Елеонская гора всегда представляла интерес для историков и церковных археологов. Привлекло также внимание и о. Антонина начальника РДМ в Иерусалиме, который в 1870 г. приобрёл участок земли неподалёку от часовни Вознесения Господня. Были обнаружены остатки церкви ранневизантийского периода, во время работ по посадке деревьев, вместе с бюстом царя Ирода (находится в Эрмитаже).
Однако главное событие, обнаружен камень, на месте которого, во время Вознесения Христа, стояла Богородица и место 1 и 2 обретения главы, Иоанна Крестителя - со временем на данном месте сооружена Часовня
В 1873 археологические работы останавливают и начало строительство церкви. Бюрократия, и русско-турецкая война приостановили постройку. В 1886 освещение храма, возведение женского монастыря, в византийском стиле. О. Антонин похоронен в 1894 г., в северном крыле собора.
В тоже время возведена колокольня Иоанна Крестителя, высотой 64 м., “Русская свеча”, достопримечательность всего Иерусалима. Елеонский колокол (308 пудов, высота 3м.), установлен в 1885 силами монахинь.
Первоначально в храме было 15 сестёр, к 1914 более 100. Остановка работы храма, с приходом первой мировой войны, здание опечатано. В 1919 возобновление функционирования.
С 1924 именуется монастырём, включает гостиницу, 3 кладбища, масличную, сосновую рощу площадью 54тыс. кв. м., каменную ограду 1,5 км.
С этого времени подчиняется ВЦУЗ, после 2007 является частью РПЦ.